Hallo Matze,
das Problem könnte sein, dass die mit Windows erzeugte Konfiguration nicht für die Console Version unter Linux passt. Ich würde dir vorschlagen die Konsole Version unter Linux initial zu starten und dann die janrufmonitor.properties bzw. janrufmonitor-syste,properties Datei per Editor zur Konfiguration zu nutzen.
Die MySQL Einträge sollten nur dann vorhanden sein, wenn du das MySQL Modul installiert hast. Ansonsten sind diese nicht vorhanden. Aber auch diese lassen sich aus den o.g. Konfigurationsdateien entfernen, in dem du alle Einträge im Namentraum des MySQL Moduls löschst.
Die Priorität legst du in janrufmonitor.properties im jeweiligen Namentraum repository.:priority:value= fest. Badi 1 die höchste und 999 die niedrigste Prio.
Viele Grüße
Thilo